继续(🕕)延续上(shàng )一季的剧情(qíng )，原来(lái )穆(🏽)德受了骗，及时(😘)发(🕟)觉错误(🔱)后和史考莉串(chuàn )通好来骗政府高层，以潜入一(yī )个(💤)“作为一个普(pǔ )通FBI特别探员不该(🖲)进入的地(🔸)方(👑)”搜集需要的资料(👁)。本(běn )季(✳)发展越来越精(🚥)彩，一些没(méi )(🎿)有被(bèi )(🥞)完(🗑)全改造的混血外星(xīng )(🚑)人(🐶)联合起来(lái )抵(dǐ )抗殖民阴(⏺)谋。史考莉被绑(bǎng )架时子宫被移(yí )除，但(dàn )今年(🦗)却(🌑)出(chū )现(xiàn )了(le )她的孩子——艾蜜莉。今年制作小组甚至(zhì )找(🙉)了(💪)两(⛓)位(🎾)知(zhī )名科幻小说家操(cāo )笔，客串写出(chū )两集(jí )剧本。另外今(jīn )年也有(🚴)一(yī )集喜(xǐ )剧(jù )。整(zhěng )(👣)出X档(🈁)案为了配合电(🥊)影的上映，加入了一些角(🏻)色(🐛)及(🌹)内容，“辛迪加”组织的阴谋(🐩)越来越明显，穆德再一次接近(jìn )事实(shí )的真相。穆德前女(nǚ )(👵)友的出(🥅)现也对穆德与(🚲)史考莉间的关系做出重(🔫)大考验。该季结束于吸烟人(rén )(👛)烧毁(😳)了所有X档案(àn )卷宗(👚)。