经(🔨)过了(⛲)十个世(shì )纪，大(dà )约(🐌)在(zài )(🍩)198X年的某(mǒu )一天，阿特姆施莱德在日本收(shōu )养了义女(nǚ )唐(táng )井(恰巧(qiǎo )是天狗施莱德小禄崎的直(zhí )(🏇)系血(📼)缘传人(🖲))，并传授了她有关忍者的一切，可(kě )能是考虑到地(dì )球(qiú )(🐖)科技(🛺)的(de )发展(zhǎn )(🎫)让他即将(jiāng )可能回到太(tài )空，所(suǒ )以他将(jiāng )唐井立为自己(🚢)的继承(chéng )人，并告(gào )诉(sù )了她自己(jǐ )是(shì )外星人(rén )的(de )一切真(zhēn )相。随后跟随地球上(shàng )其它逃亡阿特姆(🙄)的消(xiāo )息，阿(💪)特(⛓)姆施莱德转战(🥫)来(🤷)到(dào )(👃)了美国(🚻)，并且(⛳)很(hěn )快拥有了纽约市长颁发的城市金钥匙，成为纽约最大的(de )资(zī )产家，家财(💍)万(wàn )贯，同(tóng )时拥有全(🐛)市(shì )最高的大(🥋)厦，并(🌪)且控制(🚶)着整(📟)个(gè )城市(shì )的(🔈)黑势(shì )力。
　　同(tóng )一时间里(💏)施莱德残(cán )忍的杀害(🐞)了身在美国的(📐)守护者滨户(👄)良(🐖)大师(shī )(🖍)，所谓守护者是地(🏓)球上崇拜并保(🕕)护阿特姆流亡者(🔪)的战士(🛃)，因为滨(bīn )(💅)户良在此之(🕺)前(qián )曾经几次(cì )请求(⛴)讨伐过天狗施(🧥)莱德的(de )五龙忍者裁判(pàn )(💕)所(suǒ )帮忙打败(bài )这(zhè )名阿(😲)特姆(mǔ )(⛅)施(shī )莱德，但(🙅)是裁(cái )(🛌)判(pàn )所表(biǎo )示他们只关心被封印起(🏆)来的天狗，认为(wéi )这(🐸)是施莱德个冒牌货，所以没(🍏)有必要与(yǔ )其(😄)一(🤠)般(bān )见(jiàn )识。这一情况惹恼了阿特(🌲)姆施莱德，之(zhī )后因为(🔰)朋(péng )友的(de )(🌸)背叛，滨(bīn )户良随(❗)阿特姆(🔚)流亡者们转移逃离了(😛)日本，但终究(jiū )还是在美国被杀害了。
　　侥幸逃(🤟)脱的滨户良(🌟)的宠物鼠(😎)斯普林特意外的与另外四(🤖)只乌(wū )龟在纽约下水(shuǐ )道沾染上了由阿特姆所制作的(Ⓜ)变异液体，变成了(le )接近人(🏥)形的变异(⏫)生(shēng )物，也就诞(dàn )生了新一代(dài )的忍者神(🈹)龟，斯普林特开(kāi )始(shǐ )训练这(🌳)些乌龟们滨户良留下的(de )忍者功(🐋)夫(👆)和知识，希(😇)望(🍄)有朝一(🌵)日(🏃)能为自己(jǐ )的(🍄)主(zhǔ )(😞)人复(fù )(❔)仇(🐺)。2003年的某(mǒu )一天，已经长大(dà )并初露(😇)锋芒的忍者(zhě )神(😜)龟们终于遇到了他(tā )(🍀)们的宿敌(🦋)，施莱德试图拉拢神(shén )龟之一(yī )的李奥纳多为(💽)自己服务，但是惨遭失败，露(lù )出邪恶本(běn )性(🖼)的阿特姆施莱德(📏)与(🤥)神龟们开(✉)始(🥤)了(le )第一战(zhàn )，最(zuì )后(hòu )在(zài )斯(sī )普林特(👘)出手帮(bāng )助(zhù )下(🌚)众(🧤)人合力(lì )将其击退。过了(le )一(yī )(🏟)段日(🚝)子(zǐ )，施莱德展(🗳)开了(🗄)复仇，并将李奥打成(➕)重伤，在朋(péng )友帮助下(xià )逃过，休(✡)养生息后(✝)神龟(guī )(🧑)们返(🍝)回纽(niǔ )(🈷)约与施莱(lái )德展开(🚲)第二次较量，最(zuì )终施莱德被(♑)李奥(ào )用腾古之剑砍下脑袋，但是我(wǒ )们知道这只是(shì )(🔛)他(🗝)的机(jī )器外壳，而神龟们(📘)的代价则是失去了(le )(🥪)他们(men )的父亲(🚲):斯(🍵)普林特(🎙)的踪迹……(🏒)为了寻(xún )找失(shī )踪(⚡)的父亲，神龟们结识(📚)了阿(👥)特姆流亡者(zhě )一(yī )族并且了解了(📫)他(📔)们(men )(📈)的历(lì )史，但是(😢)就在(zài )这时，施莱德再度出现了，一(yī )番(🚴)大(🎶)战(zhàn )后，施莱(🏾)德露出了(🍉)他的(de )真面目，眼见阿(ā )特(✝)姆(🍯)一族(🌳)利用传送门逃(👲)离(lí )地球，千年的复仇计划(🌓)毁于一旦，施(shī )莱德气(qì )急败坏的要与神龟们同归于尽(jìn )，而最终(zhōng )神(shén )龟们利用传(chuán )送门(mén )逃生(shēng )，施莱(🔡)德则(zé )在一(yī )(🏷)片爆(🕶)炸声(🛹)中(zhōng )消失了(➿)踪迹……